Zlínská liga mužů 2009/2010 je rozdělena do dvou skupin [A] a [B]. Každý tým ve své skupině odehraje s každým soupeřem 3 zápasy. To je celkem 18 zápasů (9 turnajů).

Vítězové z obou skupin postoupí do play-off, kde mezi sebou odehrají 3 vzájemné zápasy o postup do 3. ligy mužů.